Au fond du bush australien imprévisible, un jeune garçon appelé Cody noue une amitié extraordinaire avec un grand aigle royal. Mais lorsqu'un braconnier sans scrupule tente de capturer l'aigle, Cody intervient pour le protéger. Sachant qu'il ne pourra y parvenir seul, il envoie un appel à l'aide auquel répondront les souris les plus courageuses du monde, Bernard et Bianca. S'embarquant sur les ailes de leur ami, l'hilarant albatros Wilbur, ces deux agents d'élite s'apprêtent à exécuter la mission la plus importante et la plus dangereuse à ce jour...